周恩来、陈延年、澎湃等人在毛泽东家吃完时，均表示要警惕国民革命军总司令蒋介石的独裁统治。毛泽东认为目前来看蒋介石还是革命的，现在主要任务是在黄埔学生中大力发展共产党员，为我发展党的军事力量，储备人才。发展共产党员要走两条路，一条是公开地发展共产党员，扬我党声威；另一条是秘密地发展共产党员，以防不测。
中山舰舰长章臣桐求见黄埔陆军军官学校教育长邓演达，声称海军代理局长李之龙向他转达蒋校长要用中山舰的命令，命中山舰赶到黄埔港候用，特来报道。
然而此时，苏联考察团要检阅中山舰，海李之龙致电兼任黄埔军校校长的蒋介石，请求将中山舰调回广州。蒋介石表示并未下达命令调动中山舰，李之龙说是军校驻省办事处欧阳格主任要的舰，说是校长的命令。此时蒋介石并未表态。
然而，1926年3月20日，蒋介石下令软禁共产国际鲍罗廷命等同志，之后，广州市公安局局长吴铁成软禁汪精卫，刘峙第二师包围省港罢工委员会，将工人纠察队集体缴械，海军副军长欧阳格逮捕李之龙，缪斌将第一军所有共党分子的党代表除周恩来外全部解除武装，扣押起来。
周恩来等共产党员被软禁在造币厂厂部，周恩来质问胡宗南谁下的扣押命令，胡宗南不敢对周恩来无礼，说是总司令的命令。
周恩来通电蒋介石，蒋介石安抚周恩来说这是一场误会。周恩来携廖仲恺夫人何香凝来见蒋介石。周恩来告诉蒋介石，这件事不是私事，是国民党右翼势力策划并发动的对于中国共产党的恶意攻击事件，他代表共产党广东区委向国民党提出严重抗议和交涉，会向全国公开事实真相。
蒋介石感到了势态的严重性，不禁放低了姿态。
毛泽东、周恩来等人认为对于蒋介石的行为必须迎头痛击，但是中共中央派张国焘前来和谈，认为我党无力与国民党对抗，要以感化、说服的态度，拉拢蒋介石，希望能够维持国共合作。
带着陈独秀的指示，张国焘心怀善意，与蒋介石进行了会谈，几乎接受了蒋介石的所有要求，同意共产党员全部退出第一军，不久季山嘉也辞别中国。为了麻痹共产党，蒋介石在会谈中也表现出与共产党继续合作的态度，他下令给矫令者欧阳格，陈肇英等人以免职处分，并关进虎门监狱。张国焘和共产国际在处理中山舰事件中的表现，让蒋介石摸到了共产党的软肋，不久蒋介石再度抛出旨在排挤共产党的整理党务案。5月15日至22日国民党二届二中全会在广州召开，张国焘代表中共中央参会,强使中共党团接受国民党的整理党务提案，由此曾在国民党中央担任部长职务的共产党员全部离职，蒋介石终于如愿以偿，将共产党从一军中全部剔除。
毛泽东严厉批判了张国焘的退让政策，共产党退出一军的结果势必让国民党右派更加嚣张，共产党要时刻做好流血牺牲的准备了。
国民革命军副总参谋长白崇禧报告蒋介石，叶开鑫部抵进湘潭，唐生智部独力难支，来电再请驰援，白崇禧为蒋介石出谋，可以使用共产党部队叶挺第四独立团。蒋介石命令第四军作为北伐的先锋军挺进湖南。
1926年广州国民政府挥师北伐，5月20日由原第四军第12师第34团改为第四军独立团番号的叶挺独立团率先从广州出发，拉开了北伐战争的序幕。6月4日独立团在渌田龙家湾，以一团之兵力克六团之敌，首战告捷。
从德国学习回来的朱德到上海见到陈独秀，向陈独秀表达希望能够上前线，直接投身战场。陈独秀知道朱德以前和湖南军阀杨森关系很好，派他到湖南做好杨森的思想工作，劝杨森投身革命，支持北伐，或者至少保持中立。朱德服从党的安排北上湖南。
毛泽东辞去国民党中央宣传部代理部长以后，担任广州农民运动讲习所所长，他在农讲所对学员进行政治训练的同时，也更加注重提高学员的军政素质。
中共广东区党委军委特派员聂荣臻在讲习所讲课时，向毛泽东传达了他的忧虑。北伐开始了，第四军被派为先锋部队冲锋陷阵很久了，吴佩孚20万大军已经进入云南，可是蒋介石的北伐大军迟迟不动，除了第四军、第七军开始行动，其他主力都是按兵不动，也不知道蒋介石在打什么算盘。
在北伐战争中，由中共共产党领导的叶挺独立团浴血奋战，英勇杀敌，表现出共产党人为中国革命事业不怕牺牲的大无畏精神。
1926年8月1日，朱德衔命来到四川万县，十四省讨贼联军川军第一路军总指挥杨森隆重接待了他，朱德的使命是以国民政府代表身份说服杨森，反戈一击，站在国民革命军一边。朱德与杨森虽为旧友，但斗转星移，物是人非，对于能否说服杨森脱吴反正，朱德心里并无把握。
广州农讲所内，毛泽东说中国革命想要成功，那么最重要的一条路，就是要研究农民，真实地体会农民现在普遍的状况。农民是中国革命的主力军，它是我们进行反帝反封建和打倒军阀的最主要力量，是取之不尽用之不竭的革命源泉，所以我们想要组织农民的力量，就要去解放他们,具体的做法就是减租减息，成立农民协会，并且建立自己的农民武装,去和地主老财、贪官污吏作斗争。只有把农民的力量都组织起来，让他们自己当家作主，广大的农民才能真正过上好日子。
自中国沦为半封建半殖民地社会以来，广大农民长期处于大地主和封建军阀的残酷压迫之下，在社会动荡、苛捐杂税、官匪横行的环境中挣扎，生存全无保障。为此，广大农民真心赞同中国共产党的农运主张，把支持北伐当成改变生存状况的希望。
国民革命军第九军第一师师长贺龙参加过讨袁战争、护法运动，在北伐中战功赫赫，在斗争中，贺龙正在寻找自己人生的方向。
